Ascalaph Designer

Опис

Асцалапх Десигнер је програм опште намене за молекуларне динамичке симулације. У оквиру јединственог графичког окружења представљене су као сопствене имплементације молекуларне динамике, као и методе класичне и квантне механике популарних програма. Карактеристике укључују молекуларну графику: више прозора, две камере по моделу, ЦПК, жичани оквир, штап, лопта и штап и ЦПК жичани оквири, изградња молекуларног модела: градитељ кристала, градитељ ланаца, цртање мишем, уређивање молекуларне геометрије, прелиминарна оптимизација , квантна оптимизација и отклањање сукоба, оптимизација молекуларне геометрије са методама коњугованог градијента, молекуларна динамика: интеграција вишеструких временских корака, интеграција четвртог реда, прорачуни суперкомпјутера уз помоћ МДинаМик-а, флексибилни СПЦ модел воде и имплицитни модел воде, и квантна хемија са ЦП2К и ПЦ ГАМЕСС/Фирефли: енергија, оптимизација молекуларне геометрије и потенцијално изведена наелектрисања.